Martín Miguel de Güemes era hijo del recaudador de la corona española, el santanderino Gabriel de Mata Güemes y Montero y de la aristócrata jujeña María Magdalena de Goyechea de la Corte.
Tras la Revolución de Mayo de 1810, Güemes se incorporó al ejército patriota destinado al Alto Perú y formó parte de las tropas victoriosas en Suipacha. Regresó a Buenos Aires y colaboró en el sitio de Montevideo.
Güemes volvió a Salta definitivamente en 1815. Gracias a su experiencia militar, organizó el frente de la resistencia a las tropas realistas, preparando a su provincia y a su pueblo para la defensa de la independencia nacional.
El 15 de mayo de 1815 fue electo Gobernador de la Provincia de Salta, cargo que ejerció hasta 1820.
A comienzo de 1821, una partida realista lo sorprendió en la ciudad de Salta, hiriéndolo de muerte.
Güemes murió en el paraje Las Higuerillas el 17 de junio de 1821.
